协议离婚，感情不和分居满二年，调解无效的情况下，可以直接向人民提起离婚诉讼。根据《民法典》第一千零七十九条，重婚、家庭暴力、等恶习以及其他导致夫妻感情破裂的情形也可以准予离婚。另外，一方被宣告失踪或经判决不准离婚后，再次分居满一年可以再次提起离婚诉讼。
法律分析
协议离婚，夫妻一方可以由有关组织进行调解或者直接向人民提起离婚诉讼。
因感情不和分居满二年，调解无效的，应当准予离婚。
《民法典》
第一千零七十九条【诉讼离婚】夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民提起离婚诉讼。
人民审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
(一)重婚或者与他人同居；
(二)实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
(三)有、吸毒等恶习屡教不改；
(四)因感情不和分居满二年；
(五)其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
拓展延伸
离婚问题：长期分居后的婚姻破裂，如何妥善解决？
长期分居后的婚姻破裂是一种复杂的问题，需要妥善解决以保护各方的权益和利益。首先，夫妻双方应积极寻求专业的法律咨询和帮助，了解离婚程序和相关法律规定。其次，双方可以考虑通过调解或仲裁等方式解决分居后的争议，以避免长时间的诉讼和纠纷。另外，夫妻间的沟通和妥协也是解决问题的关键。双方可以尝试进行家庭疏导，通过倾听对方的需求和意见，寻找共同的解决方案。此外，如果有子女存在，他们的利益应被优先考虑，双方应合理划分抚养权和财务责任。最重要的是，双方应保持冷静和理智，避免情绪化的决策，以确保离婚问题得到妥善解决，为双方和子女的未来打下良好的基础。
结语
长期分居后的婚姻破裂是一种复杂的问题，需要妥善解决以保护各方的权益和利益。夫妻双方应积极寻求专业的法律咨询和帮助，了解离婚程序和相关法律规定。通过调解或仲裁等方式解决争议，夫妻间的沟通和妥协也是关键。子女利益应优先考虑，合理划分抚养权和财务责任。保持冷静和理智，确保离婚问题得到妥善解决，为双方和子女的未来打下良好基础。
法律依据
中华人民共和国民法典：第四章 离婚 第一千零九十一条 有下列情形之一，导致离婚的，无过错方有权请求损害赔偿：
（一）重婚；
（二）与他人同居；
（三）实施家庭暴力；
（四）虐待、遗弃家庭成员；
（五）有其他重大过错。
中华人民共和国民法典：第四章 离婚 第一千零七十六条 夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。
中华人民共和国民法典：第一章 一般规定 第一千一百六十四条 本编调整因侵害民事权益产生的民事关系。