法律分析：
因为是代理进口，则在进口报关是注明“代理进口”，且报关单上写代理公司和被代理公司两个名称，则对于货款部分，海关将开具代理公司和被代理公司双抬头的海关代征专用，那么，这张被代理公司可以直接拿去抵扣，代理公司可以另外开具服务费给被代理公司。
法律依据：
《营业税改征试点有关事项的规定》一、营改增试点期间，试点纳税人有关 （三）销售额。 4.经纪代理服务，以取得的全部价款和价外费用，扣除向委托方收取并代为支付的性基金或者行政事业性收费后的余额为销售额。向委托方收取的性基金或者行政事业性收费，不得开具专用。